我校学子暑期备战国际遗传工程机器设计竞赛电子科技大学成电新闻网

分享到微信 ×

打开微信“扫一扫”
即可将网页分享至朋友圈

我校学子暑期备战国际遗传工程机器设计竞赛

文：韩映萍图：韩映萍来源：生命学院时间：2014-08-17 2473

　　国际遗传工程机器设计竞赛(iGEM)决赛将在今年10月30日到11月3日举行。今年我校有两支iGEM参赛队伍，分别是实验队UESTC-China和软件队UESTC-Software。两支队伍在暑期，都在积极备战该项赛事。

　　实验队今年主要的参赛项目是利用合成生物学建造能够大量吸收并代谢甲醛的植株。为了能够成功完成这一项目，从今年四月，实验队人员就开始从文献资料入手大量查阅相关文献，在张勇、郑雪莲、汤丽霞三位老师的指导下，完成了实验项目的方案制定。五月开始，实验队人员开始进入实验室进行实验。暑假期间，实验队有九名11级学生和三名12级本科生留校实验，进行艰苦的暑期集训生活。

　　CRISPR/ CAS热潮席卷了整个科学界，当然合成生物学和iGEM大赛也不例外。sgRNA设计工具是CRISPR/ CAS技术的重要组成部分，并吸引了世界各地生物信息学学者。然而，所有可用的工具忽略了特定实验的目的，不注重生物砖标准，不支持合成生物学数据交换标准（SBOL）。因此，一个用于合成生物学基因组编辑sgRNA设计工具，是迫切需要的。软件队的项目中，提出了CRISPR-X，一个全面支持SBOL和生物砖标准，拥有基于目的功能，底盘和最新的实验数据的动态算法的sgRNA设计工具。它采用C / S和B / S架构。在服务器端的程序是用C实现，前端是用PHP（浏览器端）或Java实现（应用于Windows，Linux和OS X的安卓终端，桌面终端），使其应用于多种平台上。这个暑假，软件队的项目也进入白热化阶段。

　　国际遗传工程机器设计竞赛(iGEM)是由美国麻省理工学院（MIT）主办的在合成生物学领域最高的国际型学术竞赛。合成生物学设计和构建人工生物组件和系统，其目标是希望重组现有的基于DNA序列的功能组件，如调控序列，蛋白质等，实现对生命科学研究或者对生产生活有意义的新菌种。而iGEM每年通过竞赛的形式为合成生物学领域提供了大量生物功能组件。iGEM不仅仅是合成生物学领域的一项比赛，要完成这项比赛，参赛队伍中还需具备有强大计算机、编程、美工等相关技术的队员。每年竞赛的奖项除了金牌、银牌、铜牌以外，还有单项奖，如最佳wiki奖，最佳poster奖，最佳创意奖等等。今年全球共有246支参赛队伍在MIT一决高下。